在神秘的南极冰层中，挖掘出了被星际之门建造者遗弃的基地。星际之门亚特兰蒂斯团队被召集去执行最冒险的星际之门任务——去遥远的天马星系。

亚特兰蒂斯团队被远古人类文明攻击了...包括无处不在的新敌人，幽灵。
伊丽莎白·威尔博士是亚特兰蒂斯队的队长。她有着出色的政治天赋，但在军队中喜欢虚张声势，在军队中担任少校职务。约翰·谢泼德是个天才司机。年轻热情的警官艾登·福特担任副驾驶。罗德尼·麦凯博士是一位聪明机智的天体物理学家，曾经在星门指挥部工作。飞船上还有一个朋友——tey la，他是天马星系Arhosian人的一个年轻漂亮的首领，与亚特兰蒂斯团队一起与幽灵战斗。

新赛季增加了很多新面孔，其中最引人注目的是为了保卫自己的星球而与幽灵战斗了七年的罗南·德克斯。还有史蒂文·卡尔德威尔上校，最新的银河战斗巡洋舰代达罗斯-代达罗斯号的指挥官。

新的一季，新的冒险，亚特兰蒂斯的冒险又回来了，带领你探索深邃的宇宙。